近日，长沙医学院发文称，长沙市税务局第三稽查局要求学校补缴2016年1月1日至2020年9月30期间包括学费和住宿费等收费的25%的企业所得税款，并支付日万分之五的滞纳金，累计约3亿多元，并两次下达强制执行通知书。学校认为上述税收没有法律依据，要求税务局依法履职。
引起行业舆论。
按照目前《中华人民共和国民办教育促进法》和《中华人民共和国企业所得税法》等相关法律、法规的规定，非营利民办学校收取的学费和住宿费是企业所得税的应税收入，是要在减去支出后缴纳企业所得税的。
为什么这样说，我们来分析一下。
按照《民办教育促进法》第四十七条规定，“民办学校享受国家规定的税收优惠政策；其中，非营利性民办学校享受与公办学校同等的税收优惠政策”。但这并不等于非营利民办学校不缴纳企业所得税，因为按照税法的规定，公办学校也是企业所得税的纳税主体，除了法定免税项目外，也得交税。
《企业所得税法实施条例》第三条规定，“企业所得税法第二条所称依法在中国境内成立的企业，包括依照中国法律、行政法规在中国境内成立的企业、事业单位、社会团体以及其他取得收入的组织”。公办学校属于里面规定的事业单位。
所以，不论是公办学校还是民办学校要想免征企业所得税，得进一步看税法上免税项目是怎么规定的。
公办学校方面，《企业所得税法》 第七条规定，“收入总额中的下列收入为不征税收入：（一）财政拨款；
（二）依法收取并纳入财政管理的行政事业性收费、政府性基金；（三）国务院规定的其他不征税收入。”恰恰，公办学校收入的大头是财政拨款。学费住宿费收取后按照“收支两条线”原则上缴财政，需要时财政拨款。
民办学校方面，《关于非营利组织企业所得税免税收入问题的通知》财税[2009]122号规定：“一、非营利组织的下列收入为免税收入：（一）接受其他单位或者个人捐赠的收入；（二）除《中华人民共和国企业所得税法》第七条规定的财政拨款以外的其他政府补助收入，但不包括因政府购买服务取得的收入；（三）按照省级以上民政、财政部门规定收取的会费；（四）不征税收入和免税收入孳生的银行存款利息收入；（五）财政部、国家税务总局规定的其他收入。
条文很明确，社会捐赠、财政补助、不征税收入和免税收入的存款利息是免税收入，学费、住宿费没有列明其中，也就是不免的。对于民办学校来说，学费、住宿费恰恰是大头。
所以，非营利民办学校的学费、住宿费，以及其他规定允许的收费项目，比如课本费、作业本费、考试报名费、伙食费、延时服务费等都是企业所得税的应税收入。
可以说，非营利民办学校的所得税问题在税务主管部门看来，是有明确的法律法规和部门规章依据的，和《民促法》的相关规定也并不矛盾。
我们现在应该做的就是呼吁修改税法的相关规定，争取把非营利民办学校的学费、住宿费等收费纳入企业所得税免税收入项目。这个呼吁也是十分合理的。
《民促法》第十九条明确规定，“非营利性民办学校的举办者不得取得办学收益，学校的办学结余全部用于办学。”
第三十八条明确规定，“民办学校收取的费用应当主要用于教育教学活动、改善办学条件和保障教职工待遇。”
第五十九条明确规定，非营利性民办学校终止，清偿债务后的剩余财产继续用于其他非营利性学校办学。
《企业所得税法实施条例》第八十四条规定，非营利组织从事公益性或者非营利性活动；取得的收入除用于与该组织有关的、合理的支出外，全部用于登记核定或者章程规定的公益性或者非营利性事业；财产及其孳息不用于分配；按照登记核定或者章程规定，该组织注销后的剩余财产用于公益性或者非营利性目的，或者由登记管理机关转赠给与该组织性质、宗旨相同的组织，并向社会公告；投入人对投入该组织的财产不保留或者享有任何财产权利；工作人员工资福利开支控制在规定的比例内，不变相分配该组织的财产。
也就是说，非营利民办学校从财产权属角度来讲，就是捐赠给社会了，是社会所有、国家所有、全民所有，举办人和学校都没有谁所得。收了学生的学费、住宿费，是为了能把教育事业办好，把公益事业办好，有了结余也要继续投入到办学中去。
所以，建议对非营利民办学校学费住宿费等收费免征企业所得税。
（民教文摘）